А всё, впилил - нужно в файле /components/com_jcomments/jcomments.php код:
if ($cacheEnabled) {
$tmpl->addVar('tpl_index', 'comments-anticache', 1);
}
заменить на:
if ($cacheEnabled) {
$tmpl->addVar('tpl_index', 'comments-list', JComments::getCommentsTree($object_id, $object_group));
}
Но при этом комменты должны быть в виде дерева.