Добрый утро.
Скорее всего причина одна из двух:
1) выставлены некорректно права на файлы и папки
2) не поддерживается работа .htaccess (если он используется)
Проверьте в информации о системе, права на папки. Также посмотрите на файлы. Оптимально для папок 755 (можно 711), для файлов 644.
Если используется .htaccess то в общих настройках сайта (в админке J!) отключите его использование и посмотрите на результат на сайте. Если все будет работать, значит ваш хостинг не поддерживает .htaccess и нужно включить модуль mod_rewrite в настройках хостинга для корректной работы сайта. Также убедитесь что вы используйте PHP как Apache или CGI .