Тут надо изначально понимать структуру джумлы, что и чем является. Шаблон это просто так скажем некая оформленная конструкция с модульными позициями. В эти модульные позиции вы ставите модули (меню, слайдеры, вывод чего либо). Многие шаблоны изначально имеют логотип и вывод меню, но у студии ютимс все основано именно на модульных позициях, рисунок логотипа нужно через штмль модуль поставить в нужную позицию, модули меню так же поставить по своим позициям.
Если сайт новый и голый, то советую ставить квикстарт (джумлу с предустановленым шаблоном и расширениями), если сайт уже наполнен чемто и обустроен, то квик старт нужно поставить отдельно на локалке например, и посмотреть что там и как устроено, какие где модули, какие у них настройки и классы суффиксов, и потом соответственно по аналогии сконструировать свой сайт.